Επειδή η «φύση» είναι ένα σύνολο διαδικασιών, όταν στηρίζεται η λειτουργία των θαλάσσιων οικοσυστημάτων. Αυτές οι πρωτότυπες λύσεις για τις πετρελαιοκηλίδες μας προβληματίζουν.
Το βασικό ερώτημα είναι: Οι τοξίνες που παράγουν αυτά τα βακτήρια τι γίνονται και πού αποδομούνται; Εάν αυτή η πράξη γίνεται στον βυθό, τότε ολόκληρος ο μικρόκοσμος ή μεγαλόκοσμος στον βυθό τι θα γίνει; Το ΠΑΚΟΕ για αυτές τις όχι τεκμηριωμένες μελέτες προβληματίζεται.
Σύμφωνα με έρευνες, υπάρχει μία ομάδα βακτηρίων σε βάθος 11χλμ. στον Ειρηνικό Ωκεανό, τα οποία μπορούν να διασπάσουν τη μοριακή σύνθεση των υδρογονανθράκων των καυσίμων. Τα βακτήρια αυτά μπορούν να επιβιώσουν και στην επιφάνεια της θάλασσας. Με αυτό τον τρόπο μπορεί να αντιμετωπιστεί η θαλάσσια ρύπανση από τα πετρελαιοειδή.